Évaluation biologique de l’état écologique

L’évaluation biologique de l’état écologique des masses d’eau constitue une étape primordiale de la mise en œuvre de la directive-cadre sur l’Eau (DCE). Elle se base sur les résultats des réseaux de surveillance et les textes règlementaires en vigueur.

COURS D’EAU

Pour les cours d’eau, les éléments de qualité biologique à prendre en compte pour l’évaluation de l’état écologique sont :

la flore aquatique ;
la faune benthique invertébrée ;
l’ichtyofaune.

Dans le cadre de la DCE, l’élément de qualité biologique « flore aquatique » comprend les macrophytes, d’une part, et les diatomées benthiques et le phytoplancton d’autre part. Dans le cadre des règles d’évaluation française de l’état écologique des eaux, macrophytes et diatomées/phytoplancton sont considérés comme deux éléments de qualité biologique distincts.

Les tableaux ci-dessous listent les indicateurs biologiques prescrits pour les cours d’eau en métropole et dans les Départements d’Outre-Mer, indiqués dans la version actuelle (arrêté modificatif du 27 juillet 2018 de l’annexe 3 de l’arrêté du 25 janvier 2010) et détaillés dans le guide relatif à l’évaluation de l’état des eaux de surface continentales.

Cours d'eau - Métropole

Eléments de qualité	Référence technique de la méthode	Code SANDRE	Type de référence technique
Phytoplancton	Elément de qualité considéré comme pertinent uniquement pour les très grands cours d’eau. Le développement de cet indicateur est prévu à partir de 2020 (prochain cycle DCE).	-	-
Phytobenthos : diatomées	Indice Biologique Diatomées (IBD₂₀₀₇) NF T90-354 (Avril 2016). Qualité de l'eau - Échantillonnage, traitement et analyse de diatomées benthiques en cours d'eau et canaux Outil complémentaire : outil diagnostic ODDiatomées Larras F., Coulaud R., Gautreau E., Billoir E., Rosebery J. & Usseglio-Polatera P. (2017) Assessing anthropogenic pressures on streams: A random forest approach based on benthic diatom communities. Science of The Total Environment 586, 1101–1112.	5856 -	Norme NF Publication scientifique
Macrophytes	Indice Biologique Macrophytique en Rivière (IBMR) Norme NF T90-395 (01.10.2003). Qualité de l’eau - Détermination de l’indice biologique macrophytique en rivière (IBMR) Guide pour l'étude des macrophytes aquatiques dans les cours d'eau- NF EN 14184 (04.2014)	2928	Norme NF
Faune benthique invertébrée	Indice invertébrés multimétriques (I₂M₂)* Usseglio-Polatera P., Mondy C.P., Larras F. & Coulaud R. 2018. Bioévaluation des cours d’eau peu profonds basée sur le compartiment des macroinvertébrés benthiques : I₂M₂ et outil diagnostique. Livret-guide. Université de Lorraine (LIEC). Mondy C., Villeneuve B., Archaimbault V., Usseglio-Polatera P. (2012). A new macroinvertebrate-based multimetric index (I2M2) to evaluate ecological quality of French wadeable streams fulfilling the WFD demands : a taxonomical and trait approach. Ecological Indicators, 18 : 452-457	7613	Rapport technique Publication scientifique
	Indice macro-invertébrés grands cours d’eau (MGCE – 12 prélèvements) Norme XP T90-337 (03.2019). Prélèvements des macro-invertébrés aquatiques en rivières profondes et canaux	6951	Norme XP
	Outil complémentaire : outil diagnostic ODInvertébrés Mondy C.P. & Usseglio-Polatera P. (2013) Using conditional tree forests and life history traits to assess specific risks of stream degradation under multiple pressure scenario. Science of The Total Environment 461–462, 750–760.	-	Publication scientifique
Ichtyofaune	Indice Poisson Rivière (IPR) Norme NF T90-344 (01.07.2011). Qualité de l’eau- Détermination de l’indice poisson rivière (IPR) Les limites d’application de l’indice sont précisées dans le document suivant : l’IPR, notice de présentation et d’utilisation (CSP, avril 2006)	7036	Norme NF Rapport technique
Ichtyofaune	Outil complémentaire : Indice Poissons Rivière+ (IPR+) Pont D., Delaigue O., Belliard J., Marzin A., Logez M. (2013). Programme IPR+ : révision de l’indice poisson rivière pour l’application de la DCE - version V.2.0 de l’indicateur, Février 2013. Rapport technique Irstea, 208 p.	-	Rapport technique

Ces informations sont données à titre indicatif, seuls les textes juridiques et les documents d’encadrement du ministère chargé de l’écologie font foi.

* De manière temporaire, pour l’hydroecorégion 9A, il est possible d’utiliser en lieu et place de l’I₂M₂ l’indice dit « équivalent » (phases A+B) de la méthode NF T90-333.

Cours d'eau - La Réunion

Eléments de qualité	Référence technique de la méthode	Type de référence technique
Phytoplancton	Elément de qualité considéré comme pertinent uniquement pour les très grands cours d’eau. En l’absence de telle typologie de cours d’eau dans à La Réunion, aucun indice phytoplancton ne sera développé pour l’évaluation de l’état	-
Phytobenthos diatomées	Indice Diatomées Réunion (IDR) Guide méthodologique de mise en œuvre de l’Indice Diatomées Réunion Un script R et sa notice d’utilisation, permettant le calcul de l’IDR, sont mis à disposition par l’Irstea (script de calcul)	Guide à paraître (collection Onema) en 2016
Macrophytes	Elément de qualité biologique non pertinent	-
Faune benthique invertébrée	Indice Réunion Macro-invertébrés (IRM) Guide méthodologique de mise en œuvre de l’Indice Réunion Macro-invertébrés	Guide à paraître (collection Onema) en 2016
Ichtyofaune	Indice Réunion Poissons (IRP) Guide méthodologique de mise en œuvre de l’Indice Réunion Poissons	Guide à paraître (collection Onema) en 2016

Ces informations sont données à titre indicatif, seuls les textes juridiques et les documents d’encadrement du ministère chargé de l’écologie font foi.

Cours d'eau - Antilles

Eléments de qualité	Référence technique de la méthode	Type de référence technique
Phytoplancton	Elément de qualité considéré comme pertinent uniquement pour les très grands cours d’eau. En l’absence de telle typologie de cours d’eau dans les Antilles, aucun indice phytoplancton ne sera développé pour l’évaluation de l’état	-
Phytobenthos diatomées	Indice Diatomées Antilles (IDA) Guide méthodologique de mise en œuvre de l’Indice Diatomées Antilles Un script R et sa notice d’utilisation, permettant le calcul de l’IDA, sont mis à disposition par Irstea (script de calcul)	Guide à paraître (collection Onema) en 2016
Macrophytes	Elément de qualité biologique non pertinent	-
Faune benthique invertébrée	Indice Biologique Macro-invertébrés Antilles (IBMA) Bernadet C., Touron-Poncet H., Bargier N. et Céréghino R., 2015. Guide méthodologique pour la mise en œuvre de l’Indice Biologique Macroinvertébré des Antilles (IBMA). Rapport Offices de l’Eau de Martinique et de Guadeloupe, Directions de l’Environnement, de l’Aménagement et du Logement de Martinique et Guadeloupe, Version 1.2, 40 p.	Guide
Faune benthique invertébrée	Guide méthodologique de mise en œuvre de l’Indice Biologique Macro-invertébrés Antilles	Guide à paraître (collection Onema) en 2016
Ichtyofaune et macro-crustacés	Elément de qualité considéré comme pertinent mais aucun indice biologique n’est actuellement disponible (optique 3ème cycle DCE)	-

Ces informations sont données à titre indicatif, seuls les textes juridiques et les documents d’encadrement du ministère chargé de l’écologie font foi.

Cours d'eau - Guyane

Eléments de qualité	Référence technique de la méthode	Type de référence technique
Phytoplancton	Elément de qualité considéré comme pertinent uniquement pour les très grands cours d’eau mais aucun indice biologique n’est actuellement disponible (optique 3ème cycle DCE)	-
Phytobenthos diatomées	Indice de Polluo-sensibilité Spécifique (IPS) Indice de Polluo-sensibilité (COSTE in CEMAGREF, 1982)Rapport d’étude Dans l’attente de mise au point d’un nouvel indice diatomique Guyanais, l’IPS, indice diatomique généraliste, est utilisé pour interpréter les inventaires diatomiques de Guyane sur la base d’une note indicielle : BOUTRY S., RAMOS M., COSTE M., ROSEBERY J., EULIN A., DELMAS F., IRSTEA, ASCONIT CONSULTANTS. Evaluation de l’Etat Ecologique des cours d’eau de Guyane à l’aide du compartiment diatomique sur la base de l’IPS (Indice de Polluosensibilité Spécifique). Rapport d’expertise, version 1 du 15-04-2014. Convention Onema-Irstea 2013-2014. 34 p.Rapport d’expertise	Rapports
Macrophytes	Elément de qualité biologique non pertinent	-
Faune benthique invertébrée	Score Moyen des Ephéméroptères de Guyane (SMEG) Guide méthodologique de mise en œuvre du Score Moyen des Ephéméroptères de Guyane	Guide à paraître (collection Onema) en 2016
Ichtyofaune	Indice Poissons Guyane Global (IPG-global) (par opposition à l’IPG Résidus : utilisé uniquement pour du diagnostic) MONCHAUX D., VIGOUROUX R., De MERONA B., 2014. Etude des données ichtyologiques DCE de Guyane 2013 - Mise à jour et étude de l’indice poisson de Guyane. Rapport Final, HYDRECO/OEG/DEAL, 80p.	Rapport
Ichtyofaune	Guide méthodologique de mise en œuvre de l’Indice Poissons Guyane Global	Guide à paraître (collection Onema) en 2016

Ces informations sont données à titre indicatif, seuls les textes juridiques et les documents d’encadrement du ministère chargé de l’écologie font foi.

Cours d'eau - Mayotte

Pas d’indice biologique actuellement disponible pour le département de Mayotte. Dans l’attente des résultats des programmes de recherche et développement et des études en la matière, le préfet coordonnateur de bassin évalue l’état écologique des masses d’eau de surface, au regard des définitions normatives indiquées en annexe 1 de l’arrêté du 27 juillet 2015, en s’appuyant sur les connaissances actuelles, des indicateurs provisoires et le dire d’expert.

PLANS D’EAU

Pour les plans d’eau, les éléments de qualité biologique à prendre en compte pour l’évaluation de l’état écologique sont :

le phytoplancton ;
les diatomées ;
les macrophytes ;
les invertébrés ;
l’ichtyofaune.

Plans d'eau - Métropole

Le tableau ci-dessous liste les indicateurs biologiques prescrits pour les plans d’eau en métropole, indiqués dans l’annexe 3 de l’arrêté du 27 juillet 2015 et détaillés dans le guide relatif à l’évaluation de l’état des eaux de surface continentales.

Eléments de qualité	Référence technique de la méthode	Code SANDRE	Type de référence technique
Phytoplancton	Indice Phytoplanctonique Lacustre (IPLAC) Les formules de calcul des valeurs de référence seront précisées dans le rapport technique intitulé « Indices de bioindications pour les plans d’eau (IPLAC, IBML, IIL) : grilles de valeurs-seuils et valeur de référence par sites pour les plans d’eau nationaux »	-	Guide à paraître
	Le détail de la méthode de calcul de l’indice est précisé dans les documents suivants Laplace-Treyture C., Feret T., Menay M., De Bartoli J., 2015. Indice Phytoplancton LACustre ou IPLAC. Irstea Groupement de Bordeaux, Equipe Carma. Note, 3 p.	-	Note
	Laplace-Treyture C., Feret T., Menay M., De Bartoli J., 2015. Ecological status assessment of french water bodies : the Phytoplankton Index of Lakes - IPLAC. Method description step by step. Version 4. Irstea Bordeaux, Water Network s, purification Quality Research Unit. 16 p.	-	Guide méthodologique
Phytobenthos : diatomées	Aucun indice biologique n’est actuellement disponible	-	-
Macrophytes	Indice Biologique Macrophytique en Lac (IBML) Les formules de calcul des valeurs de référence seront précisées dans le rapport technique intitulé « Indices de bioindications pour les plans d’eau (IPLAC, IBML, IIL) : grilles de valeurs-seuils et valeur de référence par sites pour les plans d’eau nationaux »	-	Guide à paraître
Macrophytes	Le détail du calcul de la métrique « Note de Trophie » constitutive de l’IBML, les règles de calcul et d’évaluation sont disponibles dans le document suivant : Boutry S., Bertrin V., Dutartre A., 2013. Méthode d’évaluation de la qualité écologique des plans d’eau basée sur les communautés de macrophytes. Indice Biologique Macrophytique en Lac (IBML) – Rapport d’avancement. Irstea, REBX, Rapport d’étape, 26 p + annexes.	-	Rapport
Faune benthique invertébrée	Aucun indice biologique n’est actuellement disponible	-	-
Ichtyofaune	Indice Ichtyofaune Lacustre (IIL) L’indice ichtyofaune lacustre à utiliser est détaillé dans : Logez M., Maire A., Argillier C. 2015. Principes et méthodes de calcul de l’Indice Ichtyofaune Lacustre, IIL . Rapport technique Irstea.	-	Guide
	Anthony Maire, Maxime Logez & Christine Argillier – Calcul des incertitudes liées à l’utilisation de l’Indice Ichtyofaune Lacustre (IIL) – Rapport AQUAREF 2015 – 23 p.l’IPR, notice de présentation et d’utilisation (CSP, avril 2006)	-	Rapport
	Les formules de calcul des valeurs de référence seront précisées dans le rapport technique intitulé « Indices de bioindications pour les plans d’eau (IPLAC, IBML, IIL) : grilles de valeurs-seuils et valeur de référence par sites pour les plans d’eau nationaux »	-	Guide à paraître

Ces informations sont données à titre indicatif, seuls les textes juridiques et les documents d’encadrement du ministère chargé de l’écologie font foi.

Plans d'eau - DOM

Pour les Départements d’Outre-Mer (DOM), aucun indice biologique n’est disponible. L’évaluation se fera donc par expertise avec l’appui technique de l’AFB (ayant intégré l'ex-Onema).

Dans cette perspective, la pertinence des différents EQB est à établir ou à confirmer. Des stratégies de suivi sont à mettre en place par EQB (période, fréquences, paramètres…) et des acquisitions de données sont à réaliser au cours du 2ème cycle DCE.