En dépit des progrès pour traiter les eaux usées, de nombreux micropolluants se retrouvent dans les milieux aquatiques. Cette pollution invisible à l'oeil nu est un enjeu de société : ce sont nos modes de production et de consommation qui sont responsables. Qu'elle soit ou non accompagnée d'innovations techniques, la lutte contre les micropolluants requiert obligatoirement des changements de pratiques dans le milieu professionnel, l'espace public et à la maison.

Mise à disposition de méthodes de surveillance et d'évaluation validées (en particulier pour la mise en oeuvre de la DCE ou de la DCSMM, et des politiques de l'eau en général), productions sur la biologie des milieux aquatiques continentaux et marins, sur les pressions qui s'y exercent, telles les pollutions chimiques et sur leur gestion, par exemples via l'amélioration de l’assainissement – collectif et non collectif, ou les changements de pratiques et d'usages affectant l'environnement.

L’Agence française pour la biodiversité (AFB) et le Comité français de l’Union internationale pour la conservation de la nature (UICN France) inaugurent un nouveau centre de ressources (CDR) dédié aux espèces exotiques envahissantes (EEE).

Le centre de ressource EEE contribuera à faire face au phénomène des espèces exotiques envahissantes et à fournir un appui à tous les acteurs qui y sont confrontés.